Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF3Q7Z739 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF3Q7Z739 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF3Q7Z739 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF3Q7Z739 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF3Q7Z739 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
YTHDF3Q7Z739 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
YTHDF3Q7Z739 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms