Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
UFSP1Q6NVU6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
UFSP1Q6NVU6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms