Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NANOGP8Q6NSW7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms