Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KRT80Q6KB66 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRT80Q6KB66 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 407 ms