Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms