Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms