Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1BQ5VTD9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms