Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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ATP6V1FQ16864 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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ATP6V1FQ16864 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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ATP6V1FQ16864 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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ATP6V1FQ16864 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V1FQ16864 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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