Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NDUFA9Q16795 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms