Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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NRF1Q16656 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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NRF1Q16656 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NRF1Q16656 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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NRF1Q16656 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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NRF1Q16656 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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NRF1Q16656 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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NRF1Q16656 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRF1Q16656 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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