Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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