Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMC2Q13753 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMC2Q13753 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms