Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5R2Q13319 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5R2Q13319 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms