Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFIAQ12857 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
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