Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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