Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNG1Q06432 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNG1Q06432 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms