Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EMX2Q04743 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms