Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CENPCQ03188 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms