Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIBQ01892 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms