Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms