Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HSF1Q00613 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms