Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED6P86452 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBED6P86452 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED6P86452 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED6P86452 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms