Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2BP67870 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2BP67870 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms