Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ITGA8P53708 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGA8P53708 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms