Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A1P52655 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A1P52655 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A1P52655 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2A1P52655 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2A1P52655 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms