Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERFP50548 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERFP50548 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERFP50548 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERFP50548 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERFP50548 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms