Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGFBR1P36897 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TGFBR1P36897 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms