Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNGA1P29973 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGA1P29973 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms