Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms