Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2CP28335 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR2CP28335 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms