Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB5P28074 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms