Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL3P19876 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CXCL3P19876 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms