Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT1P17948 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT1P17948 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT1P17948 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT1P17948 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT1P17948 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT1P17948 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT1P17948 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT1P17948 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT1P17948 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT1P17948 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT1P17948 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT1P17948 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT1P17948 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT1P17948 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT1P17948 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT1P17948 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT1P17948 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT1P17948 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT1P17948 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT1P17948 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT1P17948 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT1P17948 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT1P17948 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT1P17948 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT1P17948 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT1P17948 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT1P17948 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT1P17948 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT1P17948 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT1P17948 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT1P17948 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT1P17948 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT1P17948 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT1P17948 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT1P17948 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT1P17948 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT1P17948 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT1P17948 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT1P17948 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms