Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYL1P12980 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms