Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTA3P0C7M3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms