Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM2P07951 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM2P07951 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM2P07951 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM2P07951 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM2P07951 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM2P07951 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM2P07951 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM2P07951 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM2P07951 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM2P07951 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM2P07951 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM2P07951 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM2P07951 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM2P07951 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM2P07951 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPM2P07951 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPM2P07951 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPM2P07951 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPM2P07951 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPM2P07951 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM2P07951 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM2P07951 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM2P07951 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms