Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NIPSNAP2O75323 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms