Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1LI2O43237 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms