Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASKO14936 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASKO14936 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASKO14936 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASKO14936 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASKO14936 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASKO14936 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASKO14936 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASKO14936 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASKO14936 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASKO14936 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASKO14936 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASKO14936 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASKO14936 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASKO14936 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASKO14936 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASKO14936 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASKO14936 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASKO14936 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASKO14936 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms