Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IKBKBO14920 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms