Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms