Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX7O00628 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX7O00628 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX7O00628 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX7O00628 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX7O00628 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX7O00628 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX7O00628 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEX7O00628 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEX7O00628 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEX7O00628 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEX7O00628 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEX7O00628 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEX7O00628 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PEX7O00628 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PEX7O00628 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PEX7O00628 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms