Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDX39AO00148 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX39AO00148 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms