Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C6orf229H3BNL8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms