Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms