Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85CA6NKD9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85CA6NKD9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms