Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms