Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOLGA6L4A6NEF3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6L4A6NEF3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms