Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
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NWD1Q149M9 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 SCN8A-203ENST00000545061 11433 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
NWD1Q149M9 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
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