Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LRRC37A17P-201ENST00000570311 4693 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 OR4D9-202ENST00000641278 6063 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CD28-201ENST00000324106 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 KIAA0040-201ENST00000423313 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC010478.1-201ENST00000601500 6762 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 COL4A6-202ENST00000372216 6570 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PBRM1-208ENST00000410007 4905 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms